| No. | バール山脈/山洞/遺跡〜エンディング |
| 51 | バール山脈/山洞/遺跡の山洞のブルードラゴンゾンビ、遺跡のロビンウインドをそれぞれ倒して通過する。 |
| 52 | ウルザ溶岩洞の工房のバニラに話しかけ、バニッシュリングの開発を依頼する。バニラに開発費として１００００フォル以上を支払ったら、魔光石を入手するためアーリグリフ地下水路へ。 |
| 53 | アーリグリフ地下水路の宝箱から魔光石を回収したあと、ウルザ溶岩洞へと戻る。 |
| 54 | ウルザ溶岩洞のバニラにアーリグリフ地下水路で入手した魔光石を渡してバニッシュリングを作製してもらう。そのあと最深部付近の壁をバニッシュリングで破壊したら、クロセルと２回戦って手なずける。戦闘終了後、クロセルに乗って聖王都シランドへ。 |
| 55 | 聖王都シランドの城内１階通路にいるクリフ、礼拝堂のマリア、自室のネル、客間のミラージュ、クレアの部屋にいるアドレー（仲間にいる場合のみ）、城下町のアルベル、食料品店のロジャー(仲間にいる場合のみ）にそれぞれ話しかけた後、白露の庭園へ向かうと自動的に宇宙船ディブロへ移動する。この時ネル、アルベル、アドレー(仲間にいる場合のみ）、ロジャー(仲間にいる場合のみ）が仲間から外れてしまう。 |
| 56 | 宇宙船ディブロのブリッジを訪れる。そのあとブリッジのマリア、上部デッキのクリフおよびランカー、下部デッキのクォーク構成員(工作隊）、倉庫にいる赤毛以外のどちらか一人のクォーク戦闘員にそれぞれ話しかけ、他のマップから下部デッキに移動する。マリアの艦内放送が流れたら、転送室から、カルサア修練場へ向かう。 |
| 57 | カルサア修練場でバンデーンに捕らえられたソフィアとロキシを救出し、屋上でビヴィグおよびバンデーン兵２体を倒す。戦闘終了後ソフィアが仲間に加わり、さらにネル、アルベル、ロジャー、の内いずれか一人が仲間に復帰する。誰が復帰するかは、事前に起こしたＰＡによって決まる。 |
| 58 | 戦闘艦アクアエリアーの個室にいるマリアと共に紋章遺伝子についての資料を調べた後、個室で休む。休息後ブリッジへ移動し、長距離転送室からムーンベースへ向かう。 |
| 59 | ムーンベースで代弁者を倒す。戦闘後スフレが仲間に加わる。その後研究所を調べ、居住区まで戻ると今後スフレを連れて行くか選択出来る。 |
| 60 | 戦闘艦アクアエリアーのブリッジへ向かった後個室で休む。ヴィスコム提督の艦内放送で呼び出されたら再度ブリッジに行き、長距離転送室からシャトルに乗り込む。 |
| 61 | 小型シャトル カルナスの船内後部の転送装置を利用して、惑星ストリームへ降下する。 |
| 62 | 惑星ストリームのタイムゲートへ行き、ソフイアが覚醒し自動的に衛星都市レコダへ。 |
| 63 | 衛星都市レコダでセキュリティサービス６体を倒す。時空ステーションからジェミティへ。 |
| 64 | ジェミティの時空ステーションからエターナルスフィア受付の係員にエターナルスフィアに参加することを伝え、端末で仲間全員に話しかける。そのあと再びマリアに話し掛けてから、ヴァンガード３号星（ペソットの森）、エリクール２号星（カルサア丘陵/アイレの丘）、ムーンベース、惑星ストリームのいずれかへ向かう。 |
| 65 | ペソットの森、カルサア丘陵/アイレの丘、ムーンベース、惑星ストリームのいずれかに行く。 |
| 66 | ジェミティの時空ステーションに行き、ステーション職員にスフィア２１１へ転送してもらう。 |
| 67 | スフィア２１１の１階でアザゼルを倒した後、５階にいるブレアからアンインストーラーを受け取る。その後ベリアルとベルゼブルを倒したら、最上階から惑星ストリームへ戻る。 |
| 68 | 惑星ストリーム(崩壊後)で代弁者、執行者、断罪者の順で連続戦闘。それらを倒したらディブロと合流する。代弁者および執行者との戦闘中、ソフィアが一時的に仲間から外れる。 |
| 69 | 宇宙船ディブロの自室のクリフ、医務室のクォーク構成員(衛星部員）、倉庫のクォーク構成員(工作隊)、会議室のクォーク構成員(かち込み隊)、ブリッジのクォーク構成員(科学技師）とそれぞれ会話する。さらにブリッジのミラージュに２回話しかけたらイリスの野へ向かう。 |
| 70 | 聖王都シランドの城の２階にいる女王に謁見し、聖殿カナンにあるセフィラの使用許可を得る。 |
| 71 | 封印洞の途中でインフェリア・アイを倒し、聖殿カナンへ向かう。 |
| 72 | 聖殿カナンの途中に出現するダークアーマー、クリスタルスタチュー、ダークアイをそれぞれ倒す。最深部に保管されているセフィラを入手したあと、シランドへ戻る。 |
| 73 | 聖王都シランドの城内２階にある謁見の間に向かい、ルシファーんの居場所についての、情報を得る。ルシファーのいる空間に通じるゲートがあるというモーゼルの古代遺跡へ行く。 |
| 74 | モーゼル砂丘到着直後に出現するキメラを倒して、モーゼルの古代遺跡へ進む。 |
| 75 | モーゼルの古代遺跡の会議場でストーンゴーレムを倒し、ファイアーウォール内へ進入する。 |
| 76 | ファイアーウォールの出口付近に出現するガゥを倒した後、螺旋の塔へ行く。 |
| 77 | 螺旋の塔でＩＭＩＴＡＴＩＶＥブレア、ルクトギアス、デスゲイズ、キマイラホークをそれぞれ倒し、捕らえられたブレアを救出する。救出後、最深部でルシファーを倒す。 |